La segunda generación del Amigo (1998-2004) creció en distancia entre ejes y estrenó un techo de acero sobre las plazas delanteras con capota plegable atrás, sumando en 1999 una versión de techo duro. Compartió base con el Rodeo y ofreció un cuatro cilindros 2.2 y un V6 3.2 de 205 hp; en Estados Unidos pasó a llamarse Rodeo Sport desde 2001, mientras en Japón siguió como MU con un turbodiésel 3.0.
